山西农业大学学报(自然科学版)

2018, v.38(12) 38-43

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葡萄DFR蛋白的生物信息学分析及自激活检测
Bioinformatics analysis and self-activation detection of Grape DFR protein

刘海霞;温灏宇;杨波;李晓慧;张鹏飞;温鹏飞;

摘要(Abstract):

[目的]生物信息学分析葡萄DFR蛋白的功能结构域和蛋白互作预测,构建DFR酵母双杂交诱饵载体,并检测其自激活活性。[方法]利用NCBI中的CDD分析DFR蛋白保守区域,STRING在线软件对DFR蛋白互作情况进行预测,采用PCR技术扩增出葡萄DFR基因,克隆至酵母双杂交诱饵载体pGBKT7中,PEG/LiAc法将阳性质粒pGBKT7-DFR转化至酵母AH109中,通过缺陷型培养基培养进行自激活检测。[结果]DFR蛋白保守区域有NADP结合位点,预测到DFR蛋白与MybPA1蛋白有互作关系。成功构建了诱饵载体pGBKT7-DFR,并且对酵母菌无毒性,对报告基因无自激活功能。[结论]本研究通过生物信息学分析得出,酵母诱饵蛋白表达载体pGBKT7-DFR,可以作为酵母双杂交诱饵载体筛选与DFR相互作用的蛋白,进而对其进行功能性研究。

关键词(KeyWords): 生物信息学;诱饵载体;酵母双杂交

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(31372013);; 山西省科技重点研发(指南)项目(201603D21105)

作者(Author): 刘海霞;温灏宇;杨波;李晓慧;张鹏飞;温鹏飞;

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